Faktorerna som bestämmer effektiviteten i DNA-syntesen

I den typiska syntesen av DNA, RNA och icke-naturliga nukleinsyror spelar avskyddnings- och kopplingssteget avgörande roller.

Avskyddningssteget är att avlägsna DMT-gruppen på det fasta underlaget eller 5'-hydroxylgruppen på den föregående nukleosiden med organisk syra, och exponera hydroxylgruppen för följande kopplingssteg.Den 3% triklorättiksyran i diklormetan eller toluen används mest för att utföra avskyddningssteget.Koncentrationen av triklorättiksyra och avskyddningstiden (avblockeringstiden) dominerar renheten hos slutprodukterna.Låg koncentration och otillräcklig avblockeringstid lämnar oreagerad DMT-grupp, som minskar utbytet och ökar de oönskade föroreningarna.Den långa avblockeringstiden kan leda till depurin av syntetiserade sekvenser, vilket bildar de oväntade föroreningarna.

Kopplingssteget är känsligt för vattenhalten i lösningsmedel och fukten i luften.Koncentrationen av vatten i syntesen bör vara mindre än 40 ppm, bättre mindre än 25 ppm.För att bibehålla det vattenfria syntestillståndet bör nukleinsyrornas syntes utföras i en miljö med låg luftfuktighet, så vi rekommenderar våra kunder att användaAmiditer upplöst utrustning, som kan lösa den pulveriserade eller oljiga fosforamiditen i vattenfri acetonitril för att undvika kontakt med luft.

Faktorerna som bestämmer effektiviteten vid DNA-syntes5
Faktorerna som bestämmer effektiviteten i DNA-syntesen4

Eftersom fosforamiditer löses upp är det bättre i icke-vattensituationen och molekylära fällor för att adsorbera spårvattnet i reagenserna och amidit, det är nödvändigt att förberedaMolekylära fällor.Vi rekommenderar 2 g subsil för 50-250ml reagensflaskor, 5g för 250-500ml reagensflaskor, 10g för 500-1000ml reagensflaskor och 20g för 1000-2000ml reagensflaskor.

Upplösningen av fosforamiditer bör utföras under den inerta atmosfären och bytet av aktivatorreagenser och acetonitril bör slutföras i tid.Capping- och Oxidationsreagenserna bör användas så snart som möjligt, de öppnade reagenserna ger mindre hållbarhet och mindre aktivitet under syntes.


Posttid: 2022-09-09